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SQVF

 

    近几年随着第二代测序技术突飞猛进的发展,高通量数据分析已经成为最关键的问题。第二代测序仪器一次测序能产生上亿条序列。在对序列进行生物学信息分析之前,首先要知道这些序列的测序质量。然而这么多的序列凭借简单的文档处理时无法知道其整体测序质量的。
    在这种情况下我们设计出了SQVF(Sequence  Quality  View  and  Filter)软件。这款软件适用于任何高通量测序平台的数据分析,只需将测序结果的fastq文件加载一次,就可以得到详细的质量分析报告。
    在得到分析报告之后还可以设定相关的过滤条件,将低质量的序列进行过滤。为后续的生物信息学分析提供更可靠的数据。


运行环境:
硬件环境:CPU 2.5HZ  内存:2GB
软件平台支持:windows系列操作系统平台。


软件使用说明:
见附件 《SQVF使用说明书